1．地球上生物演化的歷史
　　地球上迄今已發現的最古老的巖石,用放射測定法測出的年齡是38億年。但是,通過測定隕石和月球巖石的年齡以及其他天文學的證據表明,地球與太陽系的形成大約在46億年前(彭奕欣、黃詩箋, 1997)。
　　(1)前寒武紀 (5.7億年前)
　　通過對1978-1980年澳洲西部出土的絲狀化石的研究,表明大約在35億年前,地球上便出現了原核生物。最早的原核生物可能是異養生物。在南非的巖石中所發現的化石表明,距今31-34億年前藍藻類(藍細菌)開始形成。藍藻是能夠進行光合作用的原核生物。大約在20億年前,光合作用所釋放出來的氧氣使大氣層中開始含有氧氣,這可能會導致許多厭氧生物的滅亡,但甲烷細菌以及它們的近緣種類仍然在無氧的環境中存留至今。由藍藻和其他原核生物占優勢的時代大約歷時20億年。

　　最早的真核生物的出現大約在距今14-15億前。真核生物的起源是生物演化史上的一個重大事件,因為伴隨著真核生物的形成,染色體、減數分裂和有性繁殖開始出現。在前寒武紀(8-6.7億年前), 真核生物中的真菌、原生動物以及藻類中的幾個門便形成了,動物與植物開始出現分化。到前寒武紀結束時,腔腸動物、環節動物或節肢動物等幾個動物的門開始形成。 　　(2)古生代
　　寒武紀(5.7---5.05億年前):在大約距今5億9000萬年前,類型豐富多樣的無脊椎動物的出現標志著寒武紀的開始。在這個時期,以三葉蟲為代表的節肢動物門以及腕足動物門、軟體動物門、多孔動物門、棘皮動物門的許多綱開始形成。這些門類存留至今,仍然有一些種類生存下來。在距今5.1億年前的海相沉積中,發現了最早的脊椎動物的遺跡-甲胄魚外甲的碎片。在寒武紀時,所有動物的門都已經形成了。

　　奧陶紀(5.05---4.38億年前):許多動物的門出現適應輻射,形成了大量的綱和目。例如棘皮動物形成了21個綱,腔腸動物門中珊瑚綱也開始出現了。奧陶紀時期,無頜、無鰭的甲胄魚大量出現并留下了完整的化石。

志留紀(距今4.38-4.08億年前):生物多樣性增加,無頜類出現多樣化。同時,有頜類中的盾皮魚開始出現。維管植物(蕨類)和節肢動物(蝎子、多足類)開始侵入陸地。

　　泥盆紀(距今4.08-3.60億年前):珊瑚和三葉蟲發生大規模的適應輻射;頭足類出現。無頜類和盾皮魚達到多樣性的高峰。泥盆紀被稱為"魚類的時代",軟骨魚類和硬骨魚類陸續起源并隨后發生了適應輻射。與此同時,兩棲類、苔蘚、維管植物(蕨類、裸子植物)和昆蟲起源于這個時期。

　　石炭紀(距今3.60-2.86億年前):陸生孢子植物(蕨類)繁盛并形成大面積的森林,兩棲動物的種類多樣化,并出現最早的爬行類。昆蟲發生適應輻射,一些原始的目(直翅目、蜚蠊目、蜉蝣目、同翅目等大量出現。

　　(3) 中生代
　　二疊紀(距今2.86-2.48億年前):爬行動物出現適應輻射,獸孔類成為占優勢的類群;昆蟲的各個類群多樣化,形成了蜻蜓目、半翅目、脈翅目、鞘翅目、雙翅目等類群。菊石大量增殖。

　　三疊紀(距今2.48-2.13億年前):菊石第二次大規模增殖,海洋無脊椎動物的一些類群(如雙殼類)的多樣性增加。裸子植物開始占優勢。爬行類出現適應輻射,形成了龜類、魚龍、蛇頸龍和初龍類(進一步形成植龍、鱷類和恐龍)。早期哺乳動物出現。大陸開始漂移。 　　侏羅紀(距今2.13-1.44億年前):恐龍多樣化,翼龍、雷龍、梁龍、劍龍、三角龍等種類出現。原始鳥類(始祖鳥等)出現。古代哺乳動物、裸子植物占優勢。大陸繼續漂移。

　　白堊紀(距今0.65-1.44億年前):大多數大陸分隔開來,恐龍繼續適應輻射并在本期結束時滅絕。最早的蛇類出現并發生適應輻射。具有現代鳥類特征的黃昏鳥出現。被子植物和哺乳類開始多樣化,有袋類與有胎盤類哺乳動物開始分化。

　　(4)新生代
　　第三紀(距今6500-200萬年前):被子植物大規模的多樣化,并成為在森林中占優勢的組成成分。昆蟲發生適應輻射,并形成了大多數的現代科。脊椎動物的許多現代科已經形成。

　　第四紀(距今200萬年前到現在):冰川反復出現,大型哺乳動物(如劍齒虎、猛犸象、大型的美洲野牛等)絕滅,人類出現。

　　2．物種形成(speciation)的基本方式
　　從原有的物種中形成一個新的物種,稱為物種形成。對于新的物種形成的機制有不同的假說,但基因突變、自然選擇是兩個基本的過程。在物種形成過程中,地理隔離和生殖隔離起了十分關鍵的作用。根據成種的區域,大致可以分為異域型、同域型和鄰域型三種。
　　
　　(1) 異域型的物種形成
　　一個物種的多個種群生活在不同的空間范圍內,由于地理隔絕使這些種群之間的基因交流出現障礙,導致特定的種群積累著不同的遺傳變異并逐漸形成各自特有的基因庫,最終與原種群產生生殖隔離,形成新的物種。
　　
　　(2) 同域型的物種形成
　　生活在同一區域內的物種,由于資源的限制和種群內部的激烈競爭,導致生態位出現分化。占據不同生態位的群體出現基因交流的障礙,通過生殖隔離而形成新的物種。
　　
　　(3) 鄰域型的物種形成
　　有些物種的分布區很廣但擴散能力較差,在其分布區的邊緣地帶的一些種群,由于棲息地環境的差別而形成基因交流的阻礙,逐漸建立起自己獨特的基因庫,并形成生殖隔離,最終形成了新的物種。